Os veículos do C.N.E. têm de estar registados como propriedade do C.N.E., em caso algum podem estar registados em nome da paróquia ou outro. Qualquer ato de registo (compra/venda/abate) deve ser feito com uma procuração emitida pela Junta Central. Para pedir esta procuração devem utilizar o seguinte email pantunes@escutismo.pt.

De acordo com a proposta aprovada no Conselho Nacional de Representantes de Novembro de 2014, a Junta Central, na data da matrícula da viatura procederá ao pagamento do Imposto Único de Circulação junto do Serviço de Finanças e enviará o respetivo comprovativo desse pagamento, através da Junta Regional, para juntarem aos documentos do veículo. Todos os Veículos do C.N.E. têm a obrigatoriedade de ter um identificador de Via Verde Circular: 02-SA-2021 da Junta Central de 24 de fevereiro de 2021, segundo a qual: Até ao final do mês de maio de 2021 todos os Agrupamentos e Juntas, que têm veículos registados em nome do CNE, são obrigados a ativar identificadores de Via Verde. Todas as viaturas que forem adquiridas a partir de fevereiro de 2021 têm obrigatoriamente de ativar o seu identificador de Via Verde para poder circular. Esta determinação não se aplica às viaturas do CNE que circulem apenas nas Regiões da Madeira e Açores.

Caberá ao Agrupamento, quando receber o comprovativo de pagamento, deslocar-se à sua Junta de Núcleo e pagar o valor deste imposto.